Como parte de su política de inclusión social a la educación pública superior, la Universidad brinda oportunidades a los sectores de la población historicamente menos favorecidos (jóvenes provenientes de los pueblos indigenas y afrohondureños, hijos de campesinos y estudiantes del género femenino), para que puedan fortalecer sus capacidades y habilidades, y una vez graduados contribuyan al mejoramiento de los medios de vida de sus comunidades y en consecuencia al crecimiento y desarrollo económico del país.

La UNA inició la inclusión de estudiantes mujeres a la carrera de agronomía en el año 1991. En los últimos dos años, además de seguir promoviendo la equidad de género en el acceso a la educación superior, la Universidad ha impulsado la inclusión de jóvenes provenientes de los nueve pueblos indigenas y afrohondureños del país.

En el presente año (2011), de los 2,122 estudiantes (1,599 internos y 523 externos) matriculados en el primer periodo académico, en función de género, 1463 son hombres (69%) y 659 mujeres (31%); en función de grupos étnicos, 250 estudiantes (12%) provienen de los pueblos autóctonos del país, distribuidos de la siguiente manera: 103 estudiantes de la etnia Lenca, 75 de la etnia Garífuna, 37 de la etnia Miskito, 11 de la etnia Pech, 9 de la etnia Chortí, 6 de la etnia Tolupan, 5 de la etnia Nahua y 4 de la etnia Tawahka.

Por otro lado, la Universidad está brindando acceso a la educación superior a campesinos e hijos de campesinos. Además, se están haciendo esfuerzos para seleccionar y brindar oportunidad de ingreso a jóvenes provenientes de los 100 municipios con menor Índice de Desarrollo Humano.

En síntesis, la política de inclusión social a la educación superior de la Universidad Nacional de Agricultura se está enfocando en los sectores de la población más vulnerables y que han sido historicamente excluidos y marginados.

Para los próximos años, la meta es que la proporción de los estudiantes provenientes de los diferentes grupos étnicos, estudiantes mujeres y estudiantes campesinos o hijos de campesinos, llegue a ser entre el 50 a 60% del total de la matrícula en la institución, convirtiendo así a la UNA en la institución educativa de Honduras con mayores indicadores de inclusión y equidad en el acceso a la educación superior.